研究中心实行管理委员会领导下的主任负责制。由学术委员会提供研究中心所需的学术和技术咨询需求。研究中心下设基础研究部、技术研发部、集成管理部、推广普及部和综合办公室五个部门，负责开展研究中心的基础研究、技术研发、集成管理、成果推广普及和日常运行管理等工作。